Jenner, 1796 yılında çiçek hastalığına yakalanan bir hastanın yarasından hazırladığı aşıyı, küçük bir çocuğa uygulamıştır. Sorasında ise yine aynı çocuğa çiçek aşılandığında herhangi bir hastalık belirtisi ortaya çıkmadığını bu yöntemin başaralı olduğunu kanıtlamıştır. Fakat bu aşıyı uygulayacağı gönüllüleri bulma konusunda oldukça sıkıntı yaşamıştır. Daha sonra bazı meslektaşlarının yardımı ile amacını gerçekleştirmeyi başarmıştır. Aynı yıl kendi kasabasında çiçek hastalığına yakalanan çocuklar üzerinde bulduğu aşıyı denemiş ve olumlu sonuç elde etmiştir. Bulduğu bu aşılama yöntemi ile bu hastalıktaki ölüm oranlarını oldukça düşürmüştür. M.D'sini 1972 yılında St. Andrews Üniversitesi'nde yapmıştır. 1796 yılında yapmış olduğu buluşları hakkında hazırlamış olduğu raporu Avrupa ve Amerika bölgelerinde ilgi görmüştür. Fakat o dönem tıpçıları tarafından dikkate alınmamıştır. 1805 yılında Londra Belediye başkanı tarafından Edward Jenner'a aşı keşfinde bulanabilmesi için şehir özgürlüğü sağlamıştır.1821 yılında dönemin Kralı olan IV. George’nin özel hekimi olarak görev yapmaya başlamıştır. Çiçek aşılama yöntemi bulunduğu zamanlarda fakir ailelerin çocukları için denenemiyordu. Ama 1850 yılında seri üretime geçilerek İngiliz hükümeti bu aşının uygulanmasını zorunlu hale getirmiştir. Çiçek aşılama yöntemi daha sonradan elde edilen başarılı sonuçlar dolayısı ile de 1870 yılında birçok insan bu aşılama yöntemi ile aşılanmıştır. Milyonlarca insanın hayatı bu şekilde kurtulmuştur. Daha sonraki yıllarda, bu aşılama yöntemi İngiltere dışına da çıkmış farklı yerlerde de uygulanmaya başlanmıştır. Bu aşılama yöntemi sayesinde dünyaya adını duyurmuş. Rus Çar’ından, Napolyon Bonapart gibi birçok devlet adamından ödüller almıştır. Ama yine de ülkesini terk etmemiştir. Bu korkutucu hastalığın, 1980 yılında Dünya Sağlık Örgütü tarafından yapılan bir açıklama ile yeryüzünden silindiği bilgisi kamuoyuna duyurulmuştur.
Ölümüne yaklaştığı dönemlerde kendini doğaya vermiş vahşi yaşamı gözlemlemiş hatta bu gözlemlerinden elde ettiği düşüncelerini On the Migraition of Birds adlı makalesini Kraliyet cemiyeti ile de paylaşmıştır. 26 Ocak 1823 tarihinde vefat etmiştir.